MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 plasmid pVSAL840

Total Repeats: 1862

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011311	TTG	2	6	45583	45588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_011311	TTG	2	6	45606	45611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_011311	ATT	2	6	45632	45637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_011311	ATT	2	6	45647	45652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_011311	AAG	2	6	45703	45708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_011311	TTA	2	6	45846	45851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778392
1007	NC_011311	CTT	3	9	45874	45882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215778392
1008	NC_011311	TTTC	2	8	45924	45931	0 %	75 %	0 %	25 %	215778392
1009	NC_011311	GTA	2	6	45954	45959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215778392
1010	NC_011311	ATA	2	6	45963	45968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215778392
1011	NC_011311	CGAC	2	8	45969	45976	25 %	0 %	25 %	50 %	215778392
1012	NC_011311	CATCAC	2	12	46108	46119	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	215778392
1013	NC_011311	ATC	2	6	46131	46136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215778392
1014	NC_011311	GA	3	6	46232	46237	50 %	0 %	50 %	0 %	215778392
1015	NC_011311	ATTA	2	8	46329	46336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_011311	TGA	3	9	46481	46489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_011311	T	6	6	46517	46522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_011311	ATTT	2	8	46542	46549	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_011311	TAGTC	2	10	46550	46559	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1020	NC_011311	GAA	2	6	46591	46596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_011311	CAA	2	6	46605	46610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_011311	AGA	2	6	46643	46648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_011311	ATT	2	6	46659	46664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_011311	ATTTCC	2	12	46703	46714	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	215778393
1025	NC_011311	TTG	2	6	46724	46729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215778393
1026	NC_011311	CAT	2	6	46748	46753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215778393
1027	NC_011311	GAA	2	6	46795	46800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215778393
1028	NC_011311	TAA	2	6	46845	46850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215778393
1029	NC_011311	T	6	6	46854	46859	0 %	100 %	0 %	0 %	215778393
1030	NC_011311	ATT	3	9	46891	46899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778393
1031	NC_011311	TCT	2	6	47054	47059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215778394
1032	NC_011311	GTC	3	9	47078	47086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215778394
1033	NC_011311	TCCT	2	8	47097	47104	0 %	50 %	0 %	50 %	215778394
1034	NC_011311	TCT	3	9	47136	47144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215778394
1035	NC_011311	GCA	2	6	47170	47175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215778394
1036	NC_011311	CAT	2	6	47187	47192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215778394
1037	NC_011311	GTT	2	6	47193	47198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215778394
1038	NC_011311	ATC	2	6	47226	47231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215778394
1039	NC_011311	TGGT	2	8	47261	47268	0 %	50 %	50 %	0 %	215778394
1040	NC_011311	T	6	6	47295	47300	0 %	100 %	0 %	0 %	215778394
1041	NC_011311	TTA	2	6	47303	47308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778394
1042	NC_011311	TCA	2	6	47332	47337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215778394
1043	NC_011311	ATCGC	2	10	47374	47383	20 %	20 %	20 %	40 %	215778394
1044	NC_011311	AATA	2	8	47487	47494	75 %	25 %	0 %	0 %	215778394
1045	NC_011311	AAT	2	6	47591	47596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_011311	TAC	2	6	47604	47609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_011311	AAG	2	6	47638	47643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_011311	GGT	2	6	47654	47659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_011311	CAA	3	9	47723	47731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_011311	ATT	2	6	47777	47782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_011311	TGTT	2	8	47808	47815	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_011311	T	6	6	47814	47819	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_011311	TAA	2	6	47877	47882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215778395
1054	NC_011311	TCA	2	6	48002	48007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215778395
1055	NC_011311	ATAA	2	8	48060	48067	75 %	25 %	0 %	0 %	215778395
1056	NC_011311	A	6	6	48100	48105	100 %	0 %	0 %	0 %	215778395
1057	NC_011311	ATC	2	6	48118	48123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215778395
1058	NC_011311	CAT	2	6	48162	48167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215778395
1059	NC_011311	T	6	6	48198	48203	0 %	100 %	0 %	0 %	215778395
1060	NC_011311	TGT	2	6	48206	48211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215778395
1061	NC_011311	CGG	2	6	48273	48278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	215778395
1062	NC_011311	CTT	2	6	48279	48284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215778395
1063	NC_011311	A	6	6	48376	48381	100 %	0 %	0 %	0 %	215778395
1064	NC_011311	T	6	6	48400	48405	0 %	100 %	0 %	0 %	215778395
1065	NC_011311	TC	3	6	48451	48456	0 %	50 %	0 %	50 %	215778395
1066	NC_011311	AGT	2	6	48457	48462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215778395
1067	NC_011311	T	6	6	48517	48522	0 %	100 %	0 %	0 %	215778395
1068	NC_011311	T	6	6	48633	48638	0 %	100 %	0 %	0 %	215778395
1069	NC_011311	TGAG	2	8	48649	48656	25 %	25 %	50 %	0 %	215778395
1070	NC_011311	A	6	6	48677	48682	100 %	0 %	0 %	0 %	215778395
1071	NC_011311	GCT	2	6	48787	48792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215778395
1072	NC_011311	GTT	2	6	48879	48884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215778395
1073	NC_011311	AAGA	2	8	48926	48933	75 %	0 %	25 %	0 %	215778395
1074	NC_011311	ACG	2	6	48940	48945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215778395
1075	NC_011311	TGT	2	6	49064	49069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_011311	CAT	2	6	49136	49141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_011311	ATTT	2	8	49145	49152	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_011311	T	7	7	49150	49156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_011311	TA	3	6	49253	49258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_011311	GAT	2	6	49331	49336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215778396
1081	NC_011311	TAT	2	6	49355	49360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778396
1082	NC_011311	GAA	2	6	49370	49375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215778396
1083	NC_011311	TCA	2	6	49405	49410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215778396
1084	NC_011311	TGA	2	6	49480	49485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215778396
1085	NC_011311	AGA	3	9	49531	49539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215778396
1086	NC_011311	ACTG	2	8	49588	49595	25 %	25 %	25 %	25 %	215778396
1087	NC_011311	TTTCA	2	10	49639	49648	20 %	60 %	0 %	20 %	215778396
1088	NC_011311	A	6	6	49688	49693	100 %	0 %	0 %	0 %	215778396
1089	NC_011311	CTT	2	6	49777	49782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215778396
1090	NC_011311	TCATT	2	10	49786	49795	20 %	60 %	0 %	20 %	215778396
1091	NC_011311	ATG	2	6	49797	49802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215778396
1092	NC_011311	CT	3	6	49823	49828	0 %	50 %	0 %	50 %	215778396
1093	NC_011311	GGT	2	6	49829	49834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	215778396
1094	NC_011311	TCT	2	6	49880	49885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215778396
1095	NC_011311	TAT	2	6	49890	49895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778396
1096	NC_011311	TTTAT	2	10	49913	49922	20 %	80 %	0 %	0 %	215778396
1097	NC_011311	TC	3	6	49950	49955	0 %	50 %	0 %	50 %	215778396
1098	NC_011311	GA	3	6	50092	50097	50 %	0 %	50 %	0 %	215778396
1099	NC_011311	AAG	2	6	50100	50105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215778396
1100	NC_011311	TGT	2	6	50242	50247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215778396
1101	NC_011311	AC	3	6	50259	50264	50 %	0 %	0 %	50 %	215778396
1102	NC_011311	TG	3	6	50293	50298	0 %	50 %	50 %	0 %	215778396
1103	NC_011311	GAA	2	6	50446	50451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215778396
1104	NC_011311	CACAG	2	10	50452	50461	40 %	0 %	20 %	40 %	215778396
1105	NC_011311	CGT	2	6	50476	50481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215778396
1106	NC_011311	TG	3	6	50545	50550	0 %	50 %	50 %	0 %	215778396
1107	NC_011311	TTA	2	6	50631	50636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778396
1108	NC_011311	AAGAA	2	10	50703	50712	80 %	0 %	20 %	0 %	215778396
1109	NC_011311	TTAC	2	8	50780	50787	25 %	50 %	0 %	25 %	215778396
1110	NC_011311	TGAT	2	8	50853	50860	25 %	50 %	25 %	0 %	215778396
1111	NC_011311	ATGAA	2	10	50904	50913	60 %	20 %	20 %	0 %	215778396
1112	NC_011311	A	7	7	51043	51049	100 %	0 %	0 %	0 %	215778396
1113	NC_011311	A	7	7	51196	51202	100 %	0 %	0 %	0 %	215778396
1114	NC_011311	TAA	2	6	51214	51219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215778396
1115	NC_011311	A	7	7	51281	51287	100 %	0 %	0 %	0 %	215778396
1116	NC_011311	ATT	2	6	51310	51315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778396
1117	NC_011311	TCA	2	6	51320	51325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215778396
1118	NC_011311	GTAT	2	8	51456	51463	25 %	50 %	25 %	0 %	215778396
1119	NC_011311	TGA	2	6	51484	51489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215778396
1120	NC_011311	GAC	2	6	51501	51506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215778396
1121	NC_011311	AAG	2	6	51510	51515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215778396
1122	NC_011311	ATTA	2	8	51520	51527	50 %	50 %	0 %	0 %	215778396
1123	NC_011311	A	6	6	51544	51549	100 %	0 %	0 %	0 %	215778397
1124	NC_011311	TTA	2	6	51550	51555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778397
1125	NC_011311	ATGT	2	8	51562	51569	25 %	50 %	25 %	0 %	215778397
1126	NC_011311	GTT	2	6	51575	51580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215778397
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1128	NC_011311	GAG	2	6	51667	51672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	215778397
1129	NC_011311	TAA	2	6	51690	51695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215778397
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1131	NC_011311	A	7	7	51722	51728	100 %	0 %	0 %	0 %	215778397
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1397	NC_011311	CATGA	2	10	63527	63536	40 %	20 %	20 %	20 %	215778406
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